6月13日，環保部點名通報了五家污染治理設施不完善、設施不正常運行的企業，并表示上述問題仍較為突出。
其中，天津太陽花暖通設備有限公司被批污染治理設施形同虛設。督查組檢查發現，該公司脈沖袋式除塵器沒有接通電源，酸霧處理設施未運行，酸霧未經處理直排。
治污設施不正常運行的并非個例。唐山遵化市廣沅裝飾磚有限公司被發現脫硫塔加藥池呈強酸性，無加藥記錄，脫硫設施不正常運行，大量青色煙氣外排。晉城市陽城縣山西綠洲紡織有限責任公司15噸流化床燃煤鍋爐污染治理設施不正常運行，煙囪排放口煙氣拖尾嚴重，呈淡黃色。菏澤市鄆城縣泰鑫木業有限公司擅自恢復生產，2噸燃煤鍋爐無脫硫設施，煙囪冒黑煙。
干擾監測數據的情況仍有發生。督查組發現，河南新鄉鴻泰紙業有限公司35噸燃煤鍋爐配套的脫硫塔底部破損，部分廢氣無組織排放；廢氣自動監測設施的采樣管有U型管段，分析儀進氣管內有大量冷凝水，干擾監測數據。
環保部要求，各督查組加大固定污染源污染治理設施不完善、不正常運行等問題的督查力度，督促地方政府依法依規從嚴從重查處違法排污企業，杜絕直排、漏排等違法排污行為。
此外，環保部通報稱，6月12日，28個督查組共檢查460家企業（單位），發現307家企業存在環境問題。存在問題的企業中，屬于“散亂污”問題企業的67家，未安裝污染治理設施的34個，治污設施不正常運行的23個，存在VOCs治理問題的75個。